Con la versión 1.6.1 se introdujo un bug nuevo en la previsualización de lo correos electrónicos transaccionables de Magento.
Si bien este error está reportado como bug en la versión 1.6.2 no está solucionado.

En el error se debe a la introducción de un htmlescape justo antes del renderizado.
Para solucionarlo no queda otra que modificar el core.

Nos vamos a app/code/core/Mage/Adminhtml/Block/System/Email/Template/Preview.php y comentamos la linea donde pone todo esto

$template->setTemplateText(
    $this->escapeHtml($template->getTemplateText())
);

Con el problema estará solucionado.
Esperemos que en próximas versiones lo dejen bien.